在对靶向肿瘤学的采访中，John Simmons博士讨论了液体活检分析在预测癌症患者对免疫检查点抑制剂治疗的反应方面的潜在作用.
他还强调了其他正在开发的用于检测MSI的液体活检分析.
John Simmons，博士
John Simmons，博士
2017年5月，FDA批准免疫检查点抑制剂彭布罗利珠单抗（Keytruda）用于治疗患有微卫星不稳定性高（MSI-H）或错配修复缺陷（dMMR）的不可切除或转移性肿瘤的患者，这些肿瘤可能是组织活检发现。然而，个人基因组诊断已经开发出一种液体活组织检查方法来检测MSI，以及在非侵入性过程中的肿瘤突变负荷（TMB）。在最近的一项研究中，
分析了61例转移癌患者，包括163份血浆样本。用98 kb泛癌58基因板鉴定无细胞DNA（cfDNA）中MSI移码等位基因。本研究中23例经组织学鉴定为MSI-H，其中18例经血浆鉴定为MSI，组织学鉴定为微卫星稳定（MSS）的病例，其特异性大于99%，敏感性为78%通过ctDNA测试都正确分类。此外，研究人员分析了该测试检测TMB的能力。液体活组织检查法检测TMB的特异性也超过99%，灵敏度为67%。
“评估免疫检查点抑制反应的有效性已证明利用基于成像的方法具有挑战性…，这项研究的作者在他们发表的报告中写道，倾斜癌症研究。“因此，基于cfDNA的全基因组分析方法可能有助于快速确定最终可能受益于免疫检查点阻断的患者。”
对于MSI和高水平TMB患者，研究人员发现，在使用免疫检查点抑制剂治疗之前，该分析能够预测无进展生存率。如果液体活组织检查能够预测癌症患者的MSI和TMB状态，这可能为医生提供一种预测pembrolizumab反应的微创方法。
在接受靶向肿瘤学采访时，个人基因组诊断转化医学副总裁John Simmons博士讨论了液体活组织检查在预测癌症患者对免疫检查点抑制剂治疗反应中的潜在作用。他还强调了其他正在开发的用于检测MSI的液体活检分析。
靶向肿瘤：用液体活检分析评估MSI检测的基本原理是什么
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-Simmons:MSI是近年来出现的一种非常有前途的预测免疫检查点抑制剂应答的生物标记物。2013年和2014年开始的研究发现，你可以根据不同肿瘤类型的MSI状况来对患者进行分层。无论肿瘤类型如何，患有MSI的患者对使用免疫检查点抑制剂如彭布罗珠单抗和nivolumab（Opdivo）治疗有更高的反应概率。这项工作导致几年前pembrolizumab获得批准，这是第一次与MSI或dMMR的泛癌肿瘤不可知生物标记物。
传统上，MSI的检测是通过对肿瘤组织的分析，经常与来自正常细胞的DNA进行比较，以了解它们是否为MSI-H。多年来，我们对MSI-H及其预测免疫治疗反应的能力非常感兴趣，因此我们开发了第一个基于下一代测序（NGS）的组织分析方法，我们在马里兰州巴尔的摩的实验室进行了这项研究。几年后，我们开发了一种基于血浆的实验室检测方法，从癌症患者的循环肿瘤DNA（ctDNA）中检测MSI-H。
FDA现在已经批准了彭布罗珠单抗用于MSI-H肿瘤患者的适应症，而且我们知道，在许多情况下，组织可能不容易获得或进行活检米可能不适合临床。我们想继续我们的工作，发展无创性的测试，使这些患者有机会筛选这个非常重要的生物标志物。这就是本研究的基本原理，以确定是否可以检测ctDNA中MSI-H的状态，并证明在临床环境中，它是类似于组织中MSI-H的预测性免疫治疗反应。
靶向肿瘤学：这项研究是如何设计的
”
Simmons：在这项研究中，我们有29名患者参加了一项临床试验，以评估彭布罗珠单方治疗的效果。根据组织状况对患者进行评估和登记。有23名MSI-H患者和6名MSS患者血浆进行了评估。
靶向肿瘤：这些患者有什么发现
”
Simmons：对于我们的发现，我们发现23例MSI-H患者中有18例是通过不同肿瘤类型的血浆检测到的，因此这是约78%的一致性。我们通过观察该分析的单核苷酸变异输出进一步评估了与TMB水平的相关性，我们发现我们可以识别高水平的TMB，这是已知的与MSI相关的。这很有帮助。
非常有趣，我们发现，通过观察ctDNA水平的变化，可以很好地确定患者，虽然MSI-H实际上对免疫检查点抑制剂单一疗法有反应。治疗开始后ctDNA水平下降的患者更有可能从治疗中获得持久的益处。使用ctDNA进行监测是一个很有希望的继续研究领域，希望1天内，这将为治疗决策提供信息。
靶向肿瘤学：肿瘤学家应该从这项研究中拿走什么
”
Simmons：从我的角度来看，外卖是MSI-H是一个非常重要的泛癌生物标记物，与在患者群体中具有非常好益处的药物相关。肿瘤学家应该注意到，通过使用这些非侵入性ctDNA分析，有一些测试是可用的，并且正在开发中，可以检测MSI，在组织不可用的情况下，
靶向肿瘤学：对于这种液体活检分析，有什么特别值得注意的吗
”
Simmons：本研究中的试验是一种综合的轮廓分析法，我们从血浆中检测出实体瘤中所有临床相关的生物标记物。这是我们在实验室开发的一项测试，是第一个确定MSI状态的ctDNA测试。
靶向肿瘤学：您对这项研究有什么下一步计划吗
”
Simmons:对于本研究中使用的这个精确测试，我们没有[下一步]的步骤。这是我们在巴尔的摩实验室进行的实验室开发的测试。然而，几年前，我们开始尝试通过开发可在全球实验室中放置的体外诊断试剂盒，使我们的NGS测试民主化。我们正在开发一种基于NGS的液体活检解决方案，称为elio等离子解决方案。这项测试在今年早些时候已经通过了CE认证，去年我们获得了FDA对该测试的MSI功能的突破性指定。
我们的工作重点是将这些实验室测试进一步发展成配套的解决方案，这些解决方案可以放在全球的实验室中，以推动NGS测试和个性化药物全球患者。
靶向肿瘤：关于elio血浆溶解试验，有什么重要的注意事项
”
Simmons：在我们的elio等离子解析产品中，最棒的是我们从巴尔的摩的实验室获取了核心知识和开发，并将其作为一个具有自动化生物信息学的配套解决方案进行开发。一旦获得批准，全球的分子实验室就可以把这种测试带入他们的实验室，并拥有相同的va获得高质量的结果。我们正在远离实验室开发的测试范式。
靶向肿瘤学：展望未来，您如何看待液体活检对癌症患者治疗决策的影响
”
Simmons：我们将继续看到越来越多的临床实用性和临床证据得到证明。我相信我们会看到FDA批准基于ctDNA的液体活组织检查。正如我所提到的，今年我们已经标记了我们的液体活检ctDNA测试，我相信我们将看到这些测试更广泛地用于晚期癌症分析，并增加晚期患者的数量，他们可以进行全面的基因组分析，并用于指导他们的治疗。我还认为，我们将真正开始看到更多的证据和实用性，使用这些测试进行纵向监测应用，并最终通过使用ctDNA测试的信息来指导患者护理过程，从而推动更好的治疗结果。
参考：
乔治亚州a，达勒姆JN，基弗洛杉矶，等。无创检测PD-1阻断治疗的肿瘤患者微卫星不稳定性和高肿瘤突变负荷。[在线发表于2019年9月10日]。Clin Cancer Res.doi:10.1158/1078-0432.CCR-19-1372。“
