Geoffrey R.
Oxnard，医学博士，讨论了液体活检不一致的检测误差.
他还强调了临床医生可以采取的优化液体活检的步骤，以及他在癌症患者的治疗环境中看到的进展.
Geoffrey R.Oxnard，医学博士
Geoffrey R.Oxnard，医学博士
虽然液体活检可以提供一种非侵入性的癌症基因分型方法，并继续融入癌症护理的领域，但假阴性和假阳性结果被认为是一个需要解决的重大挑战，根据Geoffrey R.Oxnard，MD.
假阴性结果与低肿瘤DNA脱落有关，限制了检测突变的能力。假阳性结果与肿瘤的异质性有关，也与正常细胞流出的肿瘤DNA有关，这些DNA会导致检测发现非肿瘤来源的突变，根据最近发表的一篇论文，inJCO Precision Oncologyby Oxnard和Dana Farber癌症中心的同事。1
Oxnard提倡对不同的分析进行基准测试，以优化液体活检的结果。在Daniel Stetson，MS等于2019年3月发表于inJCO Precision Oncology的一篇论文中，研究人员通过比较4种下一代测序（NGS）检测循环肿瘤DNA的突变，研究了液体活检和肿瘤活检之间的不一致性。根据Stetson等，2种
，对组织的阳性预测值在36%到80%之间。然而，当突变的等位基因片段（AF）大于1%而低于1%时，分析结果更为一致。
“一个主要的结论是，我们需要对在低水平上捕获的变异更加怀疑，因为在低水平上，分析误差有时会影响准确性，“Oxnard说，”
在接受目标肿瘤学采访时，Dana Farber癌症研究所的医学肿瘤学家、哈佛医学院的医学副教授Oxnard讨论了液体活检不一致的检测错误。他还强调了临床医生可以采取的优化液体活检的步骤，以及他在癌症患者的治疗环境中看到这种变化的地方。
靶向肿瘤学：你能分享一些液体活检的背景知识及其在癌症中的应用吗
”
Oxnard：癌症基因分型可能在逻辑上很棘手，因为通常没有足够的肿瘤组织可用于基因组分析。当活检不方便或不切实际时，液体活检可用于尝试无创获取基因型。这可以在基因型未知的晚期肺癌中进行，其中EGFR检测是FDA批准的获得基因型的方法，这可以在耐药机制未知的情况下进行，其中血浆基因分型可用于寻找靶向耐药机制。
我们知道液体活检有局限性；并非所有癌症都会脱落肿瘤DNA，因此假阴性比较常见。大约20%到30%的时间会错过突变。为此，FDA声明，如果血液测试为阴性，则这些测试被批准作为反映肿瘤测试的测试，因为血液测试为阴性不是确定的。
靶向肿瘤学：你能提供一些关于液体活检检测错误问题的背景资料吗
”
Oxnard：我们开始更好地理解为什么有时液体活检和肿瘤活检会发现不同的结果。最常见的原因是血浆DNA中没有肿瘤DNA；这是一种低脱落的肿瘤，会导致假阴性结果。
越来越多，我们正在理解为什么血液检测发现不同于肿瘤活检的其他原因。例如，假阴性的另一个原因是测试没有很好地构建来发现被检测到的复杂变体的突变。例如，在血浆中很难找到扩增，除非肿瘤含量很高，否则血液检测通常会漏掉扩增。
“kdsp”另一方面，我们也看到假阳性越来越普遍。误报的问题有多种原因。肿瘤的异质性可以解释这一点，但更多的时候，我们发现它与克隆性造血、白细胞的突变有关，这些突变进入血浆并在液体活检中发现。它们看起来可能是肿瘤突变，但实际上是血液循环中的良性突变。液体活检可以看到假阴性和假阳性，医生必须意识到这一点。
靶向肿瘤：假阴性和假阳性发生的频率是多少
”
Oxnard：如果你用简单的分析方法问一个简单的问题，你会得到一个简单的答案。例如，如果你只是用靶向的EGFR检测来寻找突变，假阳性是非常罕见的，假阴性发生的时间大约是30%，因为这些检测在转移性肺癌中的敏感性大约是70%。
如果你问一个复杂的问题和一个复杂的检测，例如，如果你正在使用NGS分析进行肿瘤基因分型，在血浆中发现非肿瘤来源的突变是很常见的。这种情况多久发生一次？根据我的经验，大多数液体活检发现一些低水平的突变，可能不是来自肿瘤。临床医生需要做的是能够仔细检查任何已知的突变是否可能是肿瘤衍生的。
靶向肿瘤学：实验室是否可以采取任何步骤来确认液体活检结果的准确性
”
Oxnard：我们将提倡相互比较分析的基准。这张纸是一张烤纸，里面有多种不同的分析方法进行比较，以获得更好的真实感。我认为实验室需要做一个很好的工作来验证他们的发现与其他的分析方法的对比，以尽量减少分析伪影或错误被称为突变的可能性。
否则，除了对白细胞进行配对测序之外，没有真正的方法来筛选出在血浆中发现白细胞突变的可能性。癌症检测分析越来越多地将白细胞与血浆同时测序，以消除错误地将白细胞突变称为肿瘤突变的可能性。
靶向肿瘤学：Stetson博士及其同事的研究结果有何意义共同调查？”
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-Oxnard：Stetson等利用癌症患者的血浆，比较了3种不同的NGS检测方法对血浆DNA测序的可靠性和一致性。他们发现，对于AF高于1%的变异，检测结果往往是一致的。对于AF低于1%的变异，某些检测发现了它们，而有些没有发现，并且在这个较低的区域存在假阳性和假阴性。其中一个主要的收获是，我们需要对在低水平下发现的变异更加怀疑，在这种情况下，分析误差有时会影响准确性。
另一个重要的发现是，在某些不一致的背后有各种原因，也是他们发现的最重要的原因之一是因为生物信息管道。测序分析包括测序和如何解释测序。他们指出的一件事是，分析可以改进他们的解释或他们的生物信息学，他们如何将测序读取转化为变量调用。这是一个重要的领域，在这个领域，化验可以通过双重检查生物信息学和优化生物信息学来提高其准确性。
目标肿瘤学：肿瘤学家应该意识到从中得到的信息是什么？
Oxnard：我们的主要信息是，我们提倡更好地验证我们在临床中使用的液体活检分析。我们是临床医生
