分析肿瘤RNA有助于将患者与最有效的癌症治疗相匹配

一种分析肿瘤基因表达的新方法可以为更多的患者提供精确的肿瘤药物。NCI研究人员的一项研究表明,这种分析肿瘤RNA的方法能够准确预测患者对靶向治疗或免疫治疗的反应。放大

当一个基因被表达时,它的DNA在转录过程中被复制到mRNA中。mRNA然后被用来通过一个称为翻译的过程制造蛋白质。

信贷:改编自OpenStax解剖学和生理学,2016年5月。NCI的科学家们设计了一种新的肿瘤分析方法,他们说这种方法有可能为更多的病人带来精确的癌症药物。新方法是基于分析肿瘤患者的基因表达。基因的表达是通过检测RNA的水平来衡量的,RNA是DNA的分子近亲。

相反,目前临床上大多数精确的医学方法都是基于对几百个基因的DNA变化(如突变)的分析。

“基于DNA的方法已经取得了一些巨大的成功,”他说研究研究员Kenneth Aldape,医学博士,NCI病理实验室主任。但是“虽然值得追求,但是这些成功是非常少的。”

虽然基于RNA的基因表达检测有可能提高精确医学水平,但是将基因表达数据转化为有助于治疗患者的信息一直是个挑战,该研究的负责人,医学博士Eytan Ruppin说。,博士,NCI癌症数据科学实验室主任。

“令人兴奋的是,这是我们第一次提出一种系统的方法,然后进行全面测试,Ruppin博士补充道:

NCI的研究人员表明,他们的方法可以准确预测患者是否对先前的靶向治疗或免疫治疗有反应。通过重新分析最近一项基于基因表达信息将患者与治疗相匹配的临床试验的数据,研究人员估计他们的方法可以将更多的患者与有益的治疗相匹配,而不是该研究所达到的水平。

,但要了解其潜在的有用性,Ruppin博士和Aldape博士都指出,新方法仍需在尚未接受治疗的患者身上进行仔细测试,并及时跟进。

NCI研究人员现在正准备逐步将新方法纳入NIH临床中心的患者护理中。这些努力将补充现有的基于DNA的方法。

研究结果于2月17日在bioRxiv上共享,bioRxiv是一个免费的在线档案馆,科学家可以在那里将他们的发现立即提供给科学界。档案中的文章没有经过同行评审,这意味着它们没有经过专家的质量和准确性评估。一份更详细的研究报告已经提交给同行评审和发表。

预测靶向治疗的反应

人类基因组中有20000到25000个基因,它们之间有着复杂的关系。对于癌细胞来说,基因之间的一些关系有助于细胞存活,而另一些则是有害的。

这些关系会影响药物对人癌症的影响。例如,针对“基因a”突变形式的治疗可能只适用于“基因B”低表达的肿瘤患者。了解这些相互作用有助于医生为个别患者选择最佳治疗方案。但要确定这种相互作用是一个巨大的挑战,因为人类基因组中有5亿个可能的基因对组合,Ruppin博士解释道,

在过去几年里,他和他的同事开发了计算工具,利用基因表达信息来推断一对基因,集中于被靶向治疗或免疫治疗击中的基因。在这项新的研究中,他们使用这些工具来分析包含数百名患者分子数据的公开数据集,并搜索整个基因组中的相互作用。

“我们所做的所有工作都是在最近几年才得以实现的。”

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