细胞核内DNA包装的改变可能激活促生长基因，从而导致癌症。
基因PDGFRA和FIP1L1通常局限于单独的环域（A），很少相互作用，但在IDH突变的肿瘤中，它们可能变得密切相关（B）。
的功劳：广泛交流/Lauren Solomon
研究脑肿瘤的研究人员已经确定了一个先前未知的遗传机制，可能有助于为了癌症。他们的发现表明，DNA在细胞核中的排列或包装方式的改变可能不适当地激活与脑癌相关的基因。
医学博士、马萨诸塞州剑桥博德研究所的Bradley Bernstein及其同事于12月23日在《自然》杂志上发表了他们的发现。这项研究的重点是被称为胶质瘤的脑肿瘤，包括低级别的胶质瘤，这些胶质瘤常有异柠檬酸脱氢酶（IDH）基因突变。
IDH基因突变可能会增加被称为甲基的化学“标记”的数量，这些标记在整个基因组的各个位置附着在DNA上。这项新发现表明，这种被称为高甲基化的过程，可能会破坏细胞核中DNA的包装，导致促生长基因的激活。
“这项研究发现了一种新的机制，可以导致癌症，并帮助我们更好地理解脑瘤，”伯恩斯坦博士说，他在波士顿马萨诸塞州总医院。“我们现在有机会看看在其他癌症中是否有类似的机制。”
如果将人类基因组端对端伸展，它的长度将达到6英尺左右。细胞通过形成数千个环状结构，在细胞核空间物理地排列DNA和蛋白质，称为染色质。伯恩斯坦博士将这些环比作系鞋带的环。然而，研究人员发现，有些环是错折的。特别是一个错误折叠的环，使两个通常位于基因组中相距很远且很少相互作用的基因——一个叫做FIP1L1的调节基因和一个叫做PDGFRA的促生长基因，这两个基因与胶质瘤的发生有关。
当这些基因紧密接触时，一个研究人员称，FIP1L1基因持续激活PDGFRA基因，导致其刺激细胞生长。他们利用来自癌症基因组图谱（TCGA）等项目的基因组数据来确定包括这两个在IDH突变的胶质瘤中异常表达的基因对。
另一个致癌机制
癌症通常是由通过各种机制不适当开启的基因驱动的，例如与基因组其他部分的DNA的突变和融合。但这项研究首次提供了证据，证明染色质包装的改变也可能是促生长基因激活的机制。
胶质瘤以外的其他类型癌症常有IDH突变，包括某些形式的白血病和淋巴瘤。这项研究的作者们已经开始在其他类型的癌症中重复他们的分析。
“这是一项非常有趣的研究，”NCI癌症基因组学中心和TCGA主任Jean-Claude Zenklusen博士评论道。“它扩展了我们对癌症发展过程复杂性的理解。”
染色质的结构“异常复杂，”旧金山加利福尼亚大学的Matthew R.Grimmer博士和Joseph F.Costello博士在一篇附带的社论中写道。被称为绝缘体的DNA片段通常确保一个回路中的基因和遗传元素不会与其他回路中的对应物相互作用。但当绝缘体发生改变或缺失时，其结果可能是不适当的基因活性，如在IDH突变胶质瘤中观察到的。
尽管FIP1L1和PDGFRA可能在IDH突变胶质瘤中协同致癌，但两个基因都没有任何突变或改变，威廉·弗拉瓦汉博士，博莱德一世的合著者
