一项新的研究表明,经常从癌细胞中删除的两个小rna可能通过与RAS蛋白相互作用来帮助抑制肿瘤。
KRAS蛋白的结构在这种艺术表现中是可见的。
的功劳:国家癌症研究所
的研究人员发现了两个经常从癌细胞中缺失的小rna与RAS基因家族之间的一种意想不到的联系,研究人员称,这种RNA分子小核仁RNA或snoRNAs可能通过抑制RAS蛋白的促癌活性来帮助抑制肿瘤。在没有这些鼾声的情况下,RAS蛋白可能变得“过度活跃”,产生促进细胞生长的连续信号。
Paul Khavari,医学博士。,斯坦福大学医学院和他的同事于11月23日在《自然遗传学》杂志上报告了他们对snoRNAs和RAS的发现。
大约三分之一的癌症涉及RAS蛋白的突变形式。更多地了解这些突变蛋白的调节机制可能会导致治疗甚至预防这些癌症的新策略。
测试鼾声在癌症中的作用
研究人员早就知道鼾声调节基本细胞活动,但最近的证据表明,它们也可能在癌症中发挥作用。为了进一步探讨这一观点,研究合著者Zurab Siprashvili博士和他的同事分析了5000多名癌症基因组图谱(TCGA)参与者的数据,这些参与者患有21种癌症中的任何一种。
研究者比较了每个参与者的肿瘤和正常基因组中的snoRNAs。这项分析显示,在21种被检测的癌症中,至少有10%的12种类型(包括皮肤癌、卵巢癌、肝癌、肺癌和乳腺癌)缺少两种打鼾,称为打鼾50a和打鼾50b,肿瘤缺乏这些rna的患者往往比肿瘤患者预后差。
其他鼾声通常通过与蛋白质结合而起作用。为了了解SNORD50A和SNORD50B的缺失如何影响癌细胞,研究人员接下来寻找与这些snoRNAs结合的癌相关蛋白。分析表明,RNAs可能与KRAS蛋白结合并抑制突变KRAS蛋白的促癌活性。
这一观点得到了其他实验的支持,这些实验表明,缺失SNORD50A和SNORD50B的人类黑色素瘤和肺癌细胞的分裂速度要比具有类似功能的细胞快他们。
探索肿瘤抑制机制
接下来,研究人员进行实验,了解这两种鼾声如何抑制RAS活性。他们发现,当SNORD50A和SNORD50B与KRAS结合时,这会抑制蛋白质被一种叫做法尼基转移酶的酶修饰的能力。利用这种酶对RAS蛋白进行修饰是使其具有完全活性所必需的。
根据他们的实验,研究人员得出结论:SNORD50A和SNORD50B是KRAS对外界信号作出适当反应所必需的。因此,当这些鼾声消失时,KRAS可能会变得异常活跃。
“发现RAS是一种RNA结合蛋白,RAS结合RNAs可以调节RAS蛋白的功能,这为旨在从治疗上利用这一观察的研究开辟了道路,”Khavari博士说。不过,他提醒说,要做到这一点,还需要做很多工作,包括分析这些相互作用的三维结构,以及识别结合RAS蛋白的全谱rna的研究。
“TCGA项目的巨大丰富性”
斯坦福大学的研究小组使用TCGA数据的方式基本相同正如其他研究人员所说,尽管这项研究关注的是可能在基因调控中起作用的小rna,但这并不典型,Jean-Claude Zenklusen博士观察到。,来自NCI癌症基因组学中心和TCGA主任的Zenklusen博士说:
“我们知道TCGA数据中有大量关于基因组调控区域的信息,我们还没有探索。”。“很高兴看到社区将数据作为这个程序将成为所有人利用的资源。这是TCGA项目丰富性的另一个例子