下一代测序对于在学术医疗中心治疗癌症的医生来说越来越有价值，但这些测试也需要更多地融入社区肿瘤实践中.
最近在2019年ASCO年会上提出的一项研究表明，随着技术的不断发展，以及匹配疗法的使用和批准，这些测试在社区环境中的使用有所增加.
Andrew McKenzie，博士
Andrew McKenzie，博士
下一代测序（NGS）对于在学术医疗中心治疗癌症的医生来说越来越有价值，但这些测试也需要更多地纳入社区肿瘤学实践。最近在2019年ASCO年会上发表的一项研究表明，随着技术的发展，以及匹配疗法的使用和批准，这些测试在社区环境中的使用有所增加。1
一个由安德鲁·麦肯齐博士领导的研究小组从Sarah Cannon研究所网络中的肿瘤学家，他们在2012年至2018年间为患者订购了基于NGS的分子分析。McKenzie等人完成了对这些数据的综合分析，以发现社区使用基于NGS的检测的趋势。
在2012年，医生在Sarah Cannon网络中订购基于NGS的检测的比率为每月5.75次，但在2018年增加到每月440次。此外，2012年共有11名肿瘤学家要求进行检测，而2018年为269名。2012年，医生利用率平均为每位医生6项测试，而2018年为每位医生22项测试。
肿瘤学家2012年主要使用存档组织，收集和测试结果之间的中间时间为131天。尽管存档的组织仍然为医生提供了关于是否存在突变的信息，但研究表明，肿瘤的突变景观可以随着时间的推移而演变和发展。然而，到2018年，活检和接受检测结果之间的中间时间减少了74%，表明有使用新鲜组织进行这些检测的趋势。2018年，收集和测试结果之间的中间时间为34天。2014年引入了
基于血浆的NGS测试；这些测试允许医生使用抽血而不是组织活检进行测试。2014年，基于血浆的NGS检测占NGS检测的4.9%，而2018年为40.1%。麦肯齐说：
“可以想象，基于血浆的NGS在临床上更容易做到，因为所需的只是抽血，而不是活组织检查。”。“2014年上市时，我们在订购基于血浆的检测时看到了真正的爆炸性进展……”
在接受Sarah Cannon个性化医疗项目经理McKenzie的采访时，讨论了在社区环境中基于NGS的测试应用的增长趋势以及在Sarah Cannon进行的分析的结果。他还强调了NGS对医生和癌症患者的价值，以及如何随着时间的推移提高利用率。
靶向肿瘤：为什么进行这项研究如此重要
”
McKenzie：这项研究很重要，因为我们对NGS结果的很多了解以及它的实用性都是基于学术医学中心发表的文章。这是非常有价值的信息，但我认为它遗漏了一点，那就是与美国大多数癌症患者的联系。重要的是，我们要总结这些信息，从测试排序和使用的角度，通过返回的实际结果来说明实际情况，以及这些结果与我们在学术医疗中心发表的已知结果有多相似或不同。这就是这项研究的动机，也是为什么我们认为这对我们来说是非常重要的。作为全国最大的临床试验供应商之一，我们认为我们有一个非常独特的机会来做这项调查并收集我们提供的数据。
靶向肿瘤学：这项研究是如何设计的
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“”Mc肯齐：这是一项非常独特的研究，在莎拉·坎农的研究中，我们对医生如何行医没有发言权。他们下令进行这些测试，并作为常规临床实践的一部分进行这些测试，因此萨拉·坎农（Sarah Cannon）发起的诱使人们下令进行这些类型的测试并不是什么大举措；这是一项关于这些测试如何在社区环境中使用的调查。这就是背景。
这只是一个调查，看看社区内发生了什么，[看看]这是如何反映出我们所知道的学术医疗中心的情况。此外，它如何与基因组医学领域的新进展相一致？例如，通过像拉罗特雷西尼布（Vitrakvi）这样的批准，我们是否发现在分子肿瘤学领域，检测数量和那些广泛批准的类型之间存在任何关联？这就是设计。这不是说服人们这么做的一种干预方式。我们要后退两步，调查人们在做什么，以及社区环境中的肿瘤医生如何利用这些测试和信息。
针对肿瘤：从分析中得出的关键结论是什么
”
麦肯齐：这项调查在2012年至2018年间进行，[包括]流行的、商业上可获得的天然气供应商数据。我们注意到，2012年至2018年间，我们网络内订购的分子图谱总数出现了市场增长。我认为2012年这个数字平均每月不到6个，2018年上升到每月440个左右。那只是在社区环境中。我想人们可能会认为这需要更长的时间，所以我们很兴奋地看到，
与此相结合，我们看到个别医生可能已经涉足并在这里或那里订购了一个测试，这些医生开始每年订购多个测试，这向我们表明，通过对这些测试进行排序，让医生继续寻找某些东西，可以获得某种价值。我们有很多关于为什么会这样以及为什么他们一直在寻找价值的假设，但我们还没有准备好分享这些。从中产生了很多有趣的想法。
我们进一步细分了测试类型。NGS检测可以分为两大类，一类是分离一块组织，从组织中提取DNA进行检测，另一类是通过常规抽血从患者血浆中分离DNA。我们称之为组织基NGS或血浆基NGS。你可以想象，基于血浆的NGS在临床上更容易做到，因为所需要的只是抽血而不是活检。2014年上市时，我们看到这些基于等离子的测试的订购量出现了真正的爆炸性增长，目前约有40%的NGS测试发生在社区环境中，这一点值得注意。我认为这是我们在这里看到的一个重要趋势，1我们想指出让人们看到。
基于组织的测试很有趣，因为它似乎总是比基于血浆的测试产生更多的突变。这可能是由于一些不同的因素，我们的团队必须教育我们周围的医学肿瘤学家。仅仅因为这个测试检测到更多的基因突变并不意味着它是一个更好的测试，而且我们把所有的突变都限定为可操作的、潜在可操作的或不可操作的，所以我们下一步要做的就是确保当这些结果再次出现时，医生们正在了解从治疗的角度来看，这些突变的百分比是可操作的、潜在可操作的或不可操作的。这是一个非常重要的区别；仅仅因为他们检测到更多的突变，并不意味着这是一个更好或更差的测试。
最后几位，我认为，显示了这些测试在临床中的应用。2012年第一次测试出来的时候nal负荷（TMB）作为免疫治疗反应的一个非常重要的生物标志物出现，除非你做这种基础广泛的NGS，否则很难获得这种外观。这是我们的意见。转移癌患者应该接受这种类型的检测。
在一定程度上，我们认为转移癌患者应该有机会进行临床试验，而且很多临床试验我们在莎拉·坎农进行的临床试验中，大约三分之一需要知道分子变化。在其中的一些研究中，分子改变并不是你通常在标准护理测试中测试的，所以我们认为尽早获得转移癌患者的信息有可能为该患者提供更多的治疗选择。这就是为什么我们相信。
是针对肿瘤的：下一步需要采取什么措施将更多的NGS纳入更多的社区实践
”
McKenzie：我们认为这类技术对任何癌症患者都是至关重要的。根据我们的经验，我们遇到的最大障碍是教育差距。我该如何处理结果？这和我们继续从医生那里得到的问题是一样的。在我们看来，分子教育对于将这些信息传递到其他社区肿瘤治疗实践中是至关重要的。
我们知道这在那些还说存在成本障碍、组织缺乏障碍的人身上是正确的，但其根源是如果一个医生了解这些测试的价值，这些其他原因成为次要的价值，他们可以走出测试。我们的立场是，如果我们能向医生提供尽可能多的关于这些检测的信息，那么这些信息就会回来，证明其价值，并将这些结果与靶向治疗、免疫治疗和临床试验联系起来，将成为医生们想为他们的病人做和得到的自然事情。
靶向肿瘤学：你如何看待NGS检测在未来十年中的作用
”
McKenzie：我认为我们将看到的是大多数晚期或转移性癌症患者获得广泛的分子图谱的趋势。我认为我们将开始看到的NGS测试类型将更全面，更少热点，更少的靶板，并且可能（移动）到一个更完整的外显子空间，或者在10年后，我不会惊讶于整个基因组测序变得更加普遍。除此之外，我希望我们能看到肿瘤正常NGS的整合，同时对生殖系和体细胞突变景观进行测序，这样你就可以提前得到图片，为你的病人提前做出最佳的治疗决定，并在病人的治疗计划中尽早得到这些信息。这可能是我的看法，变得更广泛，更深，更容易获得比现在。
我也假设，我们会看到更多的论文出来证明使用NGS从一个基于价值的医学角度。我认为，这将大大改变这些检查的覆盖范围，以及医生在订购时对此的反应如何。
针对性肿瘤学：您认为未来几年还应解决哪些挑战
”
McKenzie：我们正在向医生提供这些信息，并在医生的分子教育方面非常积极主动，这样当病人进来时，他们就不必问或回答他们不知道的问题。另一方面，这也是事实，武装病人，并能让病人与他们的医生谈论这些测试。
我们今天谈了很多关于NGS的潜在好处，但我认为我也有理由
